等位基因
一般指位于一对同源染色体的相同位置上控制着相对性状的一对基因。它可能出现在染色体某特定座位上的两个或多个基因中的一个。
等位基因控制相对性状的显隐性关系及遗传效应，可将等位基因区分为不同的类别。在个体中，等位基因的某个形式(显性的)可以比其他形式(隐性的)表达得多。
复等位基因
若一个染色体上的等位基因染色体上的等位基因座位上的基因以两个以上的状态存在，便称为复等位基因。若成对的等位基因中两个成员完全相同，则该个体对此性状来说成为纯合子。若两个等位基因各不相同，则该个体对该性状来说是杂合子。
例如决定人类ABO血型系统的等位基因有三种，分别为IA、IB和i。就每个人而言，只可能具有这3种复等位基因中的1种或2种，从而表现出特定的血型。在这里，A和B对i而言是显性，IA和IB是共显性，i是隐性。
结构上的区别
① 等位基因的根本区别是脱氧核苷酸排列顺序不同。
② 等位基因上的遗传信息不相同。
1）遗传信息是指：基因中的碱基排列顺序（或脱氧核苷酸的排列顺序）。
2）等位基因如A和a基因，A为显性基因，a为隐性基因，二者的碱基排列顺序是不同的。
所以，等位基因上的遗传信息不相同。
