一代测序结果峰图的基本知识

1、一代测序结果 测序公司发送的测序结果一般有一个峰图文件和一个序列文件,峰图文件为ABI格式,用chromas软件(网上可下载)打开。峰图用四种颜色的波形代表四种碱基的信号强度;正常的峰图,波峰与波谷清晰,峰与峰之间的距离均匀;比较理想的测序结果在底部应该没有杂峰干扰; 2、起始序列说明 1)测序结果的前几十bp不能用(下图中黄色区域标出的区域),在拼接序列或序列 …

分子遗传标记的优点

分子遗传标记是以物种突变造成DNA片段多态性为基础的,具有许多优点: 1、直接探测DNA水平的差异,不受时、空的限制; 2、标记数量丰富、多态性高; 3、共显性标识,可以区分纯合子与杂合子; 4、可以解释家系内某些个体的遗传变异; 5、可以鉴定不同性别、不同年龄的个体。 随着基因工程特别是DNA重组技术的发展,现在人们已确知动物不但有毛色、体态、血型、染色体等的多态性 …

什么是遗传标记?有哪些类型?

遗传标记(Genetic Marker)指可追踪染色体、染色体某一节段、某个基因座在家系中传递的任何一种遗传特性。它具有两个基本特征,即可遗传性和可识别性,因此生物的任何有差异表型的基因突变型均可作为遗传标记。 自从19世纪中期,奥地利学者孟德尔首创了将形态学性状作为遗传标记的应用先例以来,遗传标记得到发展和丰富。形态学标记、细胞学标记、生化标记、免疫学标记等一直被 …

微卫星不稳定性(MSI)的检测方法及意义

微卫星 20世纪80年代后期,Marshfield医学研究基金会的James和俄勒冈健康科学大学的Wis等人分离出来一种比小卫星DNA具有更短重复单元的卫星DNA(每单元长度在1~6bp之间),被称为微卫星DNA,又被称作短串连重复(Short Tandem Repeats, STRs)或简单重复序列(Simple Sequence Repeat, SSRs)。 小帖示:DNA重复主要分为“散在重复序列”和“串联重复序列”两大类,其中“串联重复序列” …

如何通过基因检测进行祖源分析

祖源分析原理 人的每一次繁衍,都是通过DNA的传递来传承自己的遗传特征。在这个过程中,人类会通过减数分裂的方式产生配子,减数分裂时同源重组现象会随机的将父母各自的染色体重新组合并传递给后代,完成遗传信息传递的同时,也保证了后代的遗传多样性。在族群的演化过程中,这种信息传递过程会积累很多DNA的突变,被称为基因的多态性,以单核苷酸多态性(SNP)为主。这些多态 …